Protein–RNA interactions for Protein: E9PUU5

Zfp839, Zinc finger protein 839, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp839E9PUU5 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp839E9PUU5 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms