Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms