Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Soga1E1U8D0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms