Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
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Gm3543D3Z235 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3543D3Z235 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3543D3Z235 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3543D3Z235 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3543D3Z235 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3543D3Z235 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3543D3Z235 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Gm3543D3Z235 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Gm3543D3Z235 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Gm3543D3Z235 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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