Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms