Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms