Protein–RNA interactions for Protein: D3YUM8

Gm4950, Proteasome subunit beta type, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4950D3YUM8 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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