Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmf1B9EKI3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
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