Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

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Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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