Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Usf3B2RUQ2 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
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Usf3B2RUQ2 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Usf3B2RUQ2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Usf3B2RUQ2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Usf3B2RUQ2 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Usf3B2RUQ2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Usf3B2RUQ2 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Usf3B2RUQ2 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms