Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AU015836B2RUM3 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms