Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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PtprbB2RU80 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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PtprbB2RU80 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
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PtprbB2RU80 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
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PtprbB2RU80 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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PtprbB2RU80 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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