Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Prrt4B2RU40 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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