Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrn3B2RS91 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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