Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC2

Usp42, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp42B2RQC2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms