Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Uhrf1bp1B2KF50 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Uhrf1bp1B2KF50 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms