Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
4930435E12RikA6X8Z9 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms