Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms