Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rtf1A2AQ19 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Rtf1A2AQ19 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms