Protein–RNA interactions for Protein: A2APX8

Scn1a, Sodium channel protein type 1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1aA2APX8 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn1aA2APX8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn1aA2APX8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn1aA2APX8 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn1aA2APX8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn1aA2APX8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn1aA2APX8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn1aA2APX8 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn1aA2APX8 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn1aA2APX8 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn1aA2APX8 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn1aA2APX8 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn1aA2APX8 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn1aA2APX8 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn1aA2APX8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn1aA2APX8 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn1aA2APX8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn1aA2APX8 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn1aA2APX8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn1aA2APX8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn1aA2APX8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn1aA2APX8 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn1aA2APX8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scn1aA2APX8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scn1aA2APX8 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scn1aA2APX8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scn1aA2APX8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scn1aA2APX8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scn1aA2APX8 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scn1aA2APX8 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scn1aA2APX8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Scn1aA2APX8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Scn1aA2APX8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Scn1aA2APX8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Scn1aA2APX8 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Scn1aA2APX8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Scn1aA2APX8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Scn1aA2APX8 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Scn1aA2APX8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Scn1aA2APX8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Scn1aA2APX8 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms