Protein–RNA interactions for Protein: A2AIR5

Grin3a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA3A, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin3aA2AIR5 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms