Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pramef6A2A8M8 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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