Protein–RNA interactions for Protein: A2A432

Cul4b, Cullin-4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 970 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4bA2A432 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cul4bA2A432 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cul4bA2A432 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cul4bA2A432 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cul4bA2A432 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cul4bA2A432 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms