Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pkd2l1A2A259 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms