Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms