Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3550W4VSN7 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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