Protein–RNA interactions for Protein: S4R2K0

Pdf, Peptide deformylase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdfS4R2K0 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdfS4R2K0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms