Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Shcbp1Q9Z179 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms