Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z104

Hmg20b, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20bQ9Z104 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hmg20bQ9Z104 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hmg20bQ9Z104 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hmg20bQ9Z104 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hmg20bQ9Z104 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hmg20bQ9Z104 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hmg20bQ9Z104 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hmg20bQ9Z104 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hmg20bQ9Z104 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hmg20bQ9Z104 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Hmg20bQ9Z104 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hmg20bQ9Z104 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hmg20bQ9Z104 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hmg20bQ9Z104 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hmg20bQ9Z104 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hmg20bQ9Z104 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hmg20bQ9Z104 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hmg20bQ9Z104 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hmg20bQ9Z104 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hmg20bQ9Z104 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Hmg20bQ9Z104 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hmg20bQ9Z104 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hmg20bQ9Z104 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hmg20bQ9Z104 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hmg20bQ9Z104 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hmg20bQ9Z104 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hmg20bQ9Z104 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hmg20bQ9Z104 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hmg20bQ9Z104 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hmg20bQ9Z104 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hmg20bQ9Z104 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hmg20bQ9Z104 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hmg20bQ9Z104 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hmg20bQ9Z104 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hmg20bQ9Z104 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hmg20bQ9Z104 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hmg20bQ9Z104 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hmg20bQ9Z104 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hmg20bQ9Z104 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hmg20bQ9Z104 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hmg20bQ9Z104 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hmg20bQ9Z104 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hmg20bQ9Z104 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hmg20bQ9Z104 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hmg20bQ9Z104 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hmg20bQ9Z104 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hmg20bQ9Z104 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hmg20bQ9Z104 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hmg20bQ9Z104 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hmg20bQ9Z104 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hmg20bQ9Z104 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hmg20bQ9Z104 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hmg20bQ9Z104 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hmg20bQ9Z104 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hmg20bQ9Z104 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hmg20bQ9Z104 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hmg20bQ9Z104 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hmg20bQ9Z104 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hmg20bQ9Z104 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hmg20bQ9Z104 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hmg20bQ9Z104 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hmg20bQ9Z104 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hmg20bQ9Z104 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hmg20bQ9Z104 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hmg20bQ9Z104 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hmg20bQ9Z104 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hmg20bQ9Z104 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hmg20bQ9Z104 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hmg20bQ9Z104 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hmg20bQ9Z104 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hmg20bQ9Z104 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hmg20bQ9Z104 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hmg20bQ9Z104 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hmg20bQ9Z104 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hmg20bQ9Z104 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hmg20bQ9Z104 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms