Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn13Q9Z0S4 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn13Q9Z0S4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn13Q9Z0S4 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn13Q9Z0S4 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn13Q9Z0S4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn13Q9Z0S4 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn13Q9Z0S4 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn13Q9Z0S4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn13Q9Z0S4 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn13Q9Z0S4 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn13Q9Z0S4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn13Q9Z0S4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn13Q9Z0S4 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn13Q9Z0S4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn13Q9Z0S4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn13Q9Z0S4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Cldn13Q9Z0S4 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn13Q9Z0S4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Cldn13Q9Z0S4 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn13Q9Z0S4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn13Q9Z0S4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Cldn13Q9Z0S4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn13Q9Z0S4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn13Q9Z0S4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn13Q9Z0S4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Cldn13Q9Z0S4 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn13Q9Z0S4 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Cldn13Q9Z0S4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn13Q9Z0S4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn13Q9Z0S4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn13Q9Z0S4 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn13Q9Z0S4 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn13Q9Z0S4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn13Q9Z0S4 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn13Q9Z0S4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Cldn13Q9Z0S4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Cldn13Q9Z0S4 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Cldn13Q9Z0S4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn13Q9Z0S4 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn13Q9Z0S4 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn13Q9Z0S4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn13Q9Z0S4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn13Q9Z0S4 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn13Q9Z0S4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cldn13Q9Z0S4 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cldn13Q9Z0S4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cldn13Q9Z0S4 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cldn13Q9Z0S4 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cldn13Q9Z0S4 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Cldn13Q9Z0S4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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