Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVE8

Pacsin2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin2Q9WVE8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms