Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVD4

Clcn5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, mousemouse

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Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn5Q9WVD4 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Clcn5Q9WVD4 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Clcn5Q9WVD4 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Clcn5Q9WVD4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms