Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV89

Stxbp4, Syntaxin-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp4Q9WV89 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms