Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUH2

Lhx9, LIM/homeobox protein Lhx9, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx9Q9WUH2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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