Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU40

Lemd3, Inner nuclear membrane protein Man1, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd3Q9WU40 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lemd3Q9WU40 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lemd3Q9WU40 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lemd3Q9WU40 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lemd3Q9WU40 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lemd3Q9WU40 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lemd3Q9WU40 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lemd3Q9WU40 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lemd3Q9WU40 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lemd3Q9WU40 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lemd3Q9WU40 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lemd3Q9WU40 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lemd3Q9WU40 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Lemd3Q9WU40 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lemd3Q9WU40 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lemd3Q9WU40 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lemd3Q9WU40 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lemd3Q9WU40 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lemd3Q9WU40 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Lemd3Q9WU40 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lemd3Q9WU40 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lemd3Q9WU40 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lemd3Q9WU40 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lemd3Q9WU40 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lemd3Q9WU40 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lemd3Q9WU40 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lemd3Q9WU40 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lemd3Q9WU40 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lemd3Q9WU40 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lemd3Q9WU40 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lemd3Q9WU40 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lemd3Q9WU40 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lemd3Q9WU40 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lemd3Q9WU40 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lemd3Q9WU40 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lemd3Q9WU40 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lemd3Q9WU40 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lemd3Q9WU40 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lemd3Q9WU40 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lemd3Q9WU40 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lemd3Q9WU40 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lemd3Q9WU40 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lemd3Q9WU40 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lemd3Q9WU40 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lemd3Q9WU40 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lemd3Q9WU40 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lemd3Q9WU40 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lemd3Q9WU40 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lemd3Q9WU40 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lemd3Q9WU40 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lemd3Q9WU40 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Lemd3Q9WU40 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lemd3Q9WU40 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms