Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scnn1bQ9WU38 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scnn1bQ9WU38 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scnn1bQ9WU38 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scnn1bQ9WU38 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Scnn1bQ9WU38 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scnn1bQ9WU38 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scnn1bQ9WU38 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scnn1bQ9WU38 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms