Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTU3

Scn8a, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn8aQ9WTU3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn8aQ9WTU3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms