Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1S8

Capn7, Calpain-7, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn7Q9R1S8 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn7Q9R1S8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms