Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1K7

Tubd1, Tubulin delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubd1Q9R1K7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubd1Q9R1K7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubd1Q9R1K7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubd1Q9R1K7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubd1Q9R1K7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubd1Q9R1K7 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubd1Q9R1K7 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubd1Q9R1K7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.64■□□□□ 0.1
Tubd1Q9R1K7 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubd1Q9R1K7 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms