Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L6

Pcm1, Pericentriolar material 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcm1Q9R0L6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcm1Q9R0L6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms