Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZB6

Nr4a3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a3Q9QZB6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms