Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ11

Exo1, Exonuclease 1, mousemouse

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Length 837 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo1Q9QZ11 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Exo1Q9QZ11 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms