Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp3Q9QY23 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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