Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpsf3Q9QXK7 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpsf3Q9QXK7 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpsf3Q9QXK7 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpsf3Q9QXK7 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpsf3Q9QXK7 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpsf3Q9QXK7 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpsf3Q9QXK7 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpsf3Q9QXK7 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpsf3Q9QXK7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpsf3Q9QXK7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpsf3Q9QXK7 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpsf3Q9QXK7 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cpsf3Q9QXK7 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cpsf3Q9QXK7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cpsf3Q9QXK7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cpsf3Q9QXK7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Cpsf3Q9QXK7 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cpsf3Q9QXK7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cpsf3Q9QXK7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cpsf3Q9QXK7 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cpsf3Q9QXK7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cpsf3Q9QXK7 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms