Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms