Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Dkk3Q9QUN9 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Dkk3Q9QUN9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Dkk3Q9QUN9 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Dkk3Q9QUN9 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Dkk3Q9QUN9 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Dkk3Q9QUN9 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Dkk3Q9QUN9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Dkk3Q9QUN9 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Dkk3Q9QUN9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Dkk3Q9QUN9 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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