Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Csnk1eQ9JMK2 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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