Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd1aQ9JLR9 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms