Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms