Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gde1Q9JL56 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gde1Q9JL56 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gde1Q9JL56 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gde1Q9JL56 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gde1Q9JL56 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gde1Q9JL56 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Gde1Q9JL56 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gde1Q9JL56 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Gde1Q9JL56 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gde1Q9JL56 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms